1-Methyl-7-nitroisatoic anhydride (1M7) 是一种检测局部核苷酸的试剂，可用于 RNA 结构分析。

LDS-751 是一种主要检测 DNA 的核酸染色剂。LDS-751 对 DNA 有很高的亲和力，结合后荧光增强，最大发射波长为 670 nm。LDS-751 和 Thiazole orange 可用于红细胞、血小板、网织红细胞和有核细胞的分化，并能在 488 nm 处激发。有研究表明，LDS-751 与有核活细胞孵育时几乎只与线粒体结合。用核染料 Acridine Orange (HY-101879) 和 LDS-751 处理细胞后，共聚焦显微镜显示细胞几乎没有共定位。使用已知可结合极化线粒体的 Rhodamine 123 (HY-D0816) 染料进行染色，与 LDS-751 观察到的模式几乎相同。

Methyl Green 是一种选择性结合 DNA 大沟的非嵌入性荧光标记剂。Methyl Green 通过带正电荷的基团与 DNA 大沟发生静电相互作用，展现出高亲和力、抗光漂白及稳定的荧光发射等关键活性。Methyl Green 可以通过显微镜和流式细胞术直接测定活性，峰值在 633 和 677 nm。Methyl Green 可用于胚胎组织或细胞的细胞核荧光标记、或凝胶电泳中 DNA 染色及细胞活性检测等。

Calcein tetraethyl ester 是钙黄绿素的四乙酯化衍生物，核心功能为活细胞特异性荧光示踪剂。Calcein tetraethyl ester 可通过缝隙连接在人牙周膜细胞间扩散，从而实现对缝隙连接细胞间通讯功能的评估，过氧化氢诱导下扩散作用增强。Calcein tetraethyl ester 可用于细胞生物学和荧光标记领域。

RB-OPD (NO-red) 是邻苯二胺 (OPD) 型的一氧化氮 (NO) 荧光探针，具有很高的灵敏度和选择性 (λex=550 nm, λem=590 nm)。

CLR1501 是荧光标记的、CLR1404 的类似物，是具有癌细胞选择性的细胞荧光标记物。

DFAME 是一种红色荧光基团 (Ex = 508 nm, Em = 641 nm)。DFAME 可与 Beetroot 和 Corn (二聚体荧光 RNA 适体) 结合形成 Beetroot-DFAME 复合体 (Kd = 460 nM) 和 Corn-DFAME 复合体 (Kd = 3600 nM)。Beetroot-DFAME 和 Corn-DFAME 可用于在细胞中形成 RNA 组装体。RNA 结构具有自组装特性，可用于进行 RNA 纳米结构的研究。

Di-4-ANEPPDHQ 是带双正电荷的极性敏感膜探针，可用于可视化观察拟南芥活细胞膜微结构域。Di-4-ANEPPDHQ 通过嵌入细胞膜后改变脂质环境极性而产生荧光光谱位移，从而量化脂质堆积程度。Di-4-ANEPPDHQ 的激发波长为 488 nm，发射波长在液态有序相和无序相分别为 560 nm 和 650 nm。Di-4-ANEPPDHQ 常用于对活细胞中膜微结构、脂质有序性及膜张力响应的荧光成像研究。

Ethidium homodimer (EthD-1) 是一种高亲和性的荧光核酸染料，常用于哺乳动物、细菌、酵母和真菌的染色。Ethidium homodimer 可与 DNA 或 RNA 结合，使荧光增强 30 多倍。Ethidium homodimer 带有较强正电荷，所以不能穿过细胞膜而染色活细胞；但 Ethidium homodimer 能穿过死细胞膜的无序区域而到达细胞核，并且嵌入 DNA 双链而产生红色荧光。因此 Ethidium homodimer 可以准确检测溶液中的核酸或者解体细胞中的核酸，是一种较灵敏的核酸染色剂。Ethidium homodimer 结合 DNA 的 Ex/Em=528/617 nm。