Cresyl Violet acetate 是一种染色剂，可用于染色神经元。

INDO 1 pentapotassium 是一种细胞不渗透性的 Ca2+ (钙离子) 荧光探针，在发射荧光的同时特异性地与 Ca2+ 结合，最大发射波长从结合前的 485 nm 向结合后的 410 nm 偏移。

5(6)-TAMRA (5(6)-Carboxytetramethylrhodamine) 是一广泛地被用作多肽和蛋白质的标记的荧光染料分子 (Ex/Em = 520/600 nm)。

Chlorophenol red (Dichlorophenolsulphonephthalein) 是一种多功能染料。染料是生物实验中的重要工具，能帮助研究人员观察和分析细胞结构、追踪生物分子、评估细胞功能、区分细胞类型、检测生物分子、研究组织病理及监测微生物，应用涵盖从基础科学研究到临床诊断的广泛领域。染料在传统领域如纺织品染色，以及新兴领域如功能性纺织品处理、食品色素和染料敏化太阳能电池等，也有广泛应用。

DMT-BH2 amidite (BHQ-2 DMT amidite) 是一种黑色淬灭染料，用于合成带有 5'-淬灭剂的 qPCR 双标记寡核苷酸探针。该淬灭剂非常适合 HEX、JOE、ROX、Cyanine5 和其他在光谱橙色和红色部分发射的染料。

5-Carboxy-X-rhodamin N-succinimidyl ester (5-ROX, SE) 是一种标记试剂，可用于制备电荷修饰的染料标记 ddNTP，以进行“直接加载” DNA 测序。

5,6-Diamino-N,N,N',N'-tetraethyl-rhodamin 是 NO 的荧光指示剂。

Cresol Red sodium 是一种三芳基甲烷染料。Cresol Red sodium 可用于指示 pH、温度和盐度。

Ethidium homodimer (EthD-1) 是一种高亲和性的荧光核酸染料，常用于哺乳动物、细菌、酵母和真菌的染色。Ethidium homodimer 可与 DNA 或 RNA 结合，使荧光增强 30 多倍。Ethidium homodimer 带有较强正电荷，所以不能穿过细胞膜而染色活细胞；但 Ethidium homodimer 能穿过死细胞膜的无序区域而到达细胞核，并且嵌入 DNA 双链而产生红色荧光。因此 Ethidium homodimer 可以准确检测溶液中的核酸或者解体细胞中的核酸，是一种较灵敏的核酸染色剂。Ethidium homodimer 结合 DNA 的 Ex/Em=528/617 nm。