RNF5 inhibitor inh-02 是一种强效的 E3 泛素连接酶 RNF5/RMA1 抑制剂。RNF5 inhibitor inh-02 恢复表达 F508del-CFTR 的永生化细胞 (CFBE41o⁻，EC50 = 2.6 μM；FRT，EC50 = 2.2 μM) 中 F508del-CFTR 的功能。RNF5 inhibitor inh-02 通过减少 ATG4B 泛素化，增加 LC3IIB 表达和自噬体数量，并促进细胞运动。RNF5 inhibitor inh-02 可用于囊性纤维化研究。

ARP101 是一种有效的选择性抑制剂基质金属蛋白酶-2 (MMP-2)。ARP101 在癌细胞中诱导自噬相关的细胞死亡。ARP101可有效诱导自噬体形成和LC3I转化为LC3II。

Tetrahydroalstonine ((-)-Tetrahydroalstonine) 是一种吲哚生物碱和选择性的 α2-肾上腺素受体拮抗剂。Tetrahydroalstonine 具有一定的神经保护作用，可通过激活 Akt/mTOR 通路调控自噬-溶酶体功能，显著减轻 OGD/R 诱导的原代皮层神经元损伤。

Indomethacin farnesil 是具有口服活性的、Indomethacin 的前体活性分子。Indomethacin (Indometacin) 是一种有效的，可透过血脑屏障的，非选择性的 COX1 和 COX2 抑制剂，在 CHO 细胞中，对人 COX-1 和 COX-2 的 IC50 值分别为 18 nM 和 26 nM。Indomethacin 通过干扰溶酶体的正常功能来破坏自噬流 (autophagic flux)。

Autocamtide-2-related inhibitory peptide 是高度特异性的、CaMKII 的有效抑制剂，其IC50 值为 40 nM。

Pepstatin (Pepstatin A) acetate 是由放线菌类产生的一种特异性的、具有口服活性的天冬氨酸蛋白酶 (aspartic proteases) 抑制剂，能够抑制 hemoglobin-pepsin、hemoglobin-proctase、casein-pepsin、casein-proctase、casein-acid protease 和 hemoglobin-acid protease 的活性，IC50 值分别为 4.5 nM、6.2 nM、150 nM、290 nM、520 nM 和 260 nM；同时可抑制 HIV protease 的活性。