DAF-FM DA (Diaminofluorescein-FM diacetate) 是一种用于一氧化氮 (NO) 检测和生物成像的荧光探针。DAF-FM DA 自发穿过质膜，随后被酯酶裂解，生成细胞内 DAF-FM (Ex/Em=495/515 nm)。

Fast-TRFS 是硫氧还蛋白还原酶 (TrxR) 的选择性超快荧光探针。Fast-TRFS 可用于对活细胞中的 TrxR 活性进行成像。

Dihydrorhodamine 123 (DHR 123) 是一种非荧光活性氧 (ROS) 指示剂。Dihydrorhodamine 123 在细胞内存在活性氧物质的情况下被氧化为荧光试剂 Rhodamine 123 (HY-D0816)，并定位于线粒体中 (Ex/Em = 515/536 nm)。

ER-Tracker 染料是与 Glibenclamide (HY-15206) 偶联的 BODIPY 列染料的衍生物，对内质网高选择性结合，在低浓度下对细胞无毒性，该类染料属于环境敏感型的探针，与甲醛处理后仍能保留部分荧光，具有荧光寿命高，消光系数好等特点。Glibenclamide 是一种 ATP 依赖性 K+ 通道阻滞剂 (Kir6, KATP) 和 CFTR Cl-通道阻滞剂，在内质网中发生结合。ER-Tracker 不适合对固定后细胞进行染色，可染色后固定，但细胞用醛固定后仅能保留部分荧光 (Ex/Em = 374/ 430-640 nm)。

MOCAc-PLGL(Dpa)AR (Mca-Pro-Leu-Gly-Leu-Dpa-Ala-Arg-NH2) 是一种合成荧光底物，主要应用于 MMP-7 的体外酶活性分析 (328 nm 激发后 393 nm 处检测)。MOCAc-PLGL(Dpa)AR 能被 MMP-7 在 Gly-Leu 肽键处特异性切割并水解，从而通过荧光法或 HPLC 法监测酶活性 (在测定动力学参数时通常需添加 DMSO 以保证其充分溶解)。MOCAc-PLGL(Dpa)AR 可用于在体外精确评估重组成熟人类 MMP-7 的催化活性及其 pH 依赖性。MOCAc-PLGL(Dpa)AR 适用于肿瘤转移与侵袭机制的研究，特别是在前列腺癌、结肠癌、肺癌及乳腺癌等领域的应用。

Coumarin 314 是一种染料，在可见光中有强烈的吸收性，还具有很大的溶剂依赖性。