5-Bromo-3-indolyl β-D-galactopyranoside (Bluo-Gal) 是一种 β-半乳糖苷酶 (β-galactosidase) 的显色底物，通过被该酶水解生成 5-溴吲哚中间体，进一步氧化形成不溶性蓝色沉淀。5-Bromo-3-indolyl β-D-galactopyranoside 可特异性识别细菌来源的β-半乳糖苷酶 (如大肠杆菌 lacZ 基因产物)，在 pH 7.4 条件下反应，适用于光镜及电子显微镜观察。5-Bromo-3-indolyl β-D-galactopyranoside 可应用于转基因生物中报告基因表达的组织化学检测，如小鼠胚胎或肌肉组织中 β-galactosidase 活性的定位分析。

FDGlcU 可作为荧光探针用于无创影像，具有高水平的荧光活性。当荧光素与两种单葡萄糖醛酸酯结合时 FDGlcU 是无荧光的 (Ex/Em=480/514 nm)。

4-MUNANA 是一种流感病毒神经氨酸酶 (NA) 的底物，具有高选择性和反应不可逆性。在酶促反应中，4-MUNANA 被 NA 催化水解，生成具有荧光的 4-Methylumbelliferone (HY-N0187)，通过检测 4-MU 的荧光强度，可实现对 NA 活性的定量分析。4-MUNANA 可用于流感相关研究，如筛选 NA 抑制剂，开发新型抗流感药物，研究流感病毒的感染机制。

Ac-DEVD-AFC 是一种荧光底物 (λex=400 nm,λem=530 nm)。

IDT307 是有机阳离子 MPP+ 的类似物，是 DAT 的荧光底物 (荧光底物 APP+)。

Ac-ANW-AMC 是免疫蛋白酶体 (immunoproteasome) 的荧光底物。Ac-ANW-AMC 可用于测量 β5i 活性 (Ex=345 nm, Em=445 nm)。