Ac-DEVD-AMC 是一种 caspase-3/caspase-7 荧光底物。用细胞裂解物处理 Ac-DEVD-AMC 时，Ac-DEVD-AMC 会释放氨基-4-甲基香豆素 (AMC) 用于荧光检测，激发波长为 380 nm，发射波长为 460 nm。

Z-Gly-Gly-Arg-AMC acetate 是凝血素特异性的荧光底物，可用于检测 PRP 和缺乏血小板血浆中凝血酶的生成 (Ex/Em = 390/480 nm)。

Mu-6S-Palm-β-Glc 是棕榈酰蛋白硫酯酶 (PPT) 的荧光底物。Mu-6S-Palm-β-Glc 可用于检测多种生物样本中的 PPT 活性。Mu-6S-Palm-β-Glc 可用于婴儿神经元蜡样脂褐质沉积症的研究。

Chlorophenol red-β-D-galactopyranoside (CPRG) 是一种高效的、灵敏的 β-galactosidase (HY-P2869) 生色底物，广泛应用于比色测定。Chlorophenol red-β-D-galactopyranoside 本身呈现淡黄色，当被 β-galactosidase 特异性水解后释放出氯酚红。释放出的氯酚红在碱性或中性 pH 条件下呈紫红色，这种从黄到红的颜色变化，可以通过可见分光光度法在 540-572 nm 波长处进行定量检测。

D-luciferin sodium 是荧光素酶 (Luc) 的天然底物，对萤火虫产生典型的黄绿光进行催化。该反应产生的 560 nm 化学发光在几秒钟内达到峰值，当底物荧光素过量时，光输出与荧光素酶浓度成正比。荧光素酶 (luc) 基因是研究和活性分子筛选的常用报告基因。化学发光技术实际上是无背景的，使得 luc 报告基因成为检测低水平基因表达的理想选择。在标准荧光计数仪中可以可靠地测量到 0.02 pg 的荧光素酶。除了用于基因表达的外，荧光素酶还用于 ATP 的检测。MCE 提供萤火虫荧光素酶 (HY-P1004A) 、荧光素游离酸 (HY-12591A) 及其水溶性钠盐 (HY-12591) 和钾盐 (HY-12591B) 。

D-Ala-Lys-AMCA hydrochloride 是一种已知的质子偶联寡肽转运蛋白 1 (PEPT1) 底物，可发出蓝色荧光。D-Ala-Lys-AMCA hydrochloride 可能被转运到肝癌细胞和 Caco-2 细胞中。D-Ala-Lys-AMCA hydrochloride 可用于表征 PEPT1 特异性底物或抑制剂 (Ex/Em = 390/480 nm)。