MBD (7-(p-Methoxybenzylamino)-4-nitrobenz-2,1,3-oxadiazole)，一种新的蛋白质和核蛋白构象荧光探针，可用于细菌核糖体、牛胰蛋白酶原和胰蛋白酶。MBD 在与大分子的疏水区域结合时具有强荧光性。

Z-Gly-Gly-Arg-AMC acetate 是凝血素特异性的荧光底物，可用于检测 PRP 和缺乏血小板血浆中凝血酶的生成 (Ex/Em = 390/480 nm)。

4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate sodium 是一种荧光染料。4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate sodium 可被半乳糖-6-硫酸酯硫酸酶脱硫生成 4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside，后者经 β-半乳糖苷酶切割后释放出具有荧光性的 4-甲基伞形酮。4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate sodium 可通过氢键、静电相互作用和空间位阻相互作用与 N-乙酰半乳糖胺-6-硫酸酯硫酸酶 (GALNS) 结合。4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate sodium 可用作检测半乳糖-6-硫酸酯硫酸酶和 GALNS 活性的底物。4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate sodium 可用于 A 型 Morquio 病 (黏多糖贮积症 IV 型 A 型) 的研究。

Mca-Pro-Leu-Ala-Cys(Mob)-Trp-Ala-Arg-Dap(Dnp)-NH2 是基质金属蛋白酶-14 (MMP-14) 的荧光底物。Mca-Pro-Leu-Ala-Cys(Mob)-Trp-Ala-Arg-Dap(Dnp)-NH2 经 MMP-14 切割后，可释放出 7-甲氧基香豆素-4-乙酰基 (Mca) (Ex/Em = 328/420 nm)。

5(6)-Carboxy-2',7'-dichlorofluorescein 是一种荧光素，是MRP2囊泡转运实验的理想底物，具有良好的检测和转运特性。

Mca-(ala7,lys(dnp)9)-bradykinin 是一种敏感的 ECE-1 (内皮素转化酶-1) 荧光底物。(7-甲氧基香豆素-4-基)乙酰基 (Mca) 荧光基团和 2,4-二硝基苯 (Dnp) 猝灭基团的加入导致底物裂解时荧光大幅增加。