CDr20 是一种可穿过血脑屏障的荧光化学探针。CDr20 可被 UDP-葡糖醛酸基转移酶 Ugt1a7c 催化发生葡糖醛酸化反应，从而触发荧光开启响应。CDr20 可实现活小胶质细胞的可视化。CDr20 的吸光度/发射波长: 568/600 nm。CDr20 可用于阿尔茨海默病、中风、自闭症的研究。

Thiazole Orange 是一种不对称的花青素染料，可与寡核苷酸 (ONs) 偶联制备荧光杂交探针。Thiazole Orange 被广泛应用于生物分子检测和胶体中的 DNA/RNA 染色，并可用于网织红细胞分析。Thiazole Orange 与核酸，特别是 RNA 结合时，会产生显著的荧光增强和高量子产率。Thiazole Orange 能够穿透活细胞膜。Thiazole Orange 可以利用紫外光进行检测，也可以用蓝光进行检测。Thiazole Orange 的激发和发射波长分别为 λex = 510 nm (488 nm 和 470 nm 也有强激发) 和 λem = 527 nm。

Stains-All，一种阳离子碳菁染料，是研究钙调蛋白 (CaM) 和相关钙结合蛋白 (CaBP) 的各个钙结合位点的结构特征的便捷探针。

Thiazole orange dimer YOYO 1 (YOYO 1) 是一种无法穿透细胞膜的碳菁二聚体，本身无荧光，当与双链 DNA (dsDNA) 结合时，其荧光强度可显著增强。Thiazole orange dimer YOYO 1 可作为细胞核复染剂或死细胞指示剂 (Ex/Em = 505/512 nm)。

Ethidium homodimer (EthD-1) 是一种高亲和性的荧光核酸染料，常用于哺乳动物、细菌、酵母和真菌的染色。Ethidium homodimer 可与 DNA 或 RNA 结合，使荧光增强 30 多倍。Ethidium homodimer 带有较强正电荷，所以不能穿过细胞膜而染色活细胞；但 Ethidium homodimer 能穿过死细胞膜的无序区域而到达细胞核，并且嵌入 DNA 双链而产生红色荧光。因此 Ethidium homodimer 可以准确检测溶液中的核酸或者解体细胞中的核酸，是一种较灵敏的核酸染色剂。Ethidium homodimer 结合 DNA 的 Ex/Em=528/617 nm。

6-HEX 是一种荧光基团，荧光团激发波长为 532 nm，发射波长为 556 nm。6-HEX 可用于标记核酸序列，设计荧光引物。6-HEX 标记的核酸可使用氩激光的 543 nm 射线识别，在 550 和 650 nm 的发射光谱 (5 nm 带宽) 下，实现对复杂组织或异质细胞群中基因的定位。