MSN8C 是曼索酮 E 的类似物，是一种新型人类 DNA 拓扑异构酶 II 催化抑制剂。MSN8C 诱导癌细胞凋亡。MSN8C 在体外表现出显着的抗肿瘤细胞增殖活性。

NBTIs-IN-6 是一种细菌拓扑异构酶抑制剂，具有一定的抗菌活性。其中，对耐氟喹诺酮类 MRSA 的 MIC90为 2 μg/mL。

Bimolane (AT-1727) 是一种人类拓扑异构酶 II 抑制剂，可用作抗肿瘤剂和用于银屑病的研究。Bimolane 显示出致白血病活性并在人淋巴细胞中诱导多种类型的染色体畸变。

Topoisomerase IIα-IN-8 (compound 15) 是一种较弱的人 DNA 拓扑异构酶 IIa (htIIa) 抑制剂，IC50 为 462 ± 38.0 μM。

Topoisomerase II inhibitor 16 (compound CT3) 是一种选择性、具有口服活性、可透过血脑屏障及不可逆的锥虫拓扑异构酶 II (trypanosomal topoisomerase II) 抑制剂，可稳定双链 DNA：酶裂解复合物。Topoisomerase II inhibitor 16 具有用于恰加斯病研究的潜力。

Pixantrone (BBR 2778 (free base)) hydrochloride, 米托蒽醌类似物, 是一种拓扑异构酶 II (topoisomerase II) 抑制剂和 DNA 嵌入剂，具有抗肿瘤活性。

N,N-Dimethyldoxorubicin 是一种阿霉素 (Doxorubicin (HY-15142A)) 类似物。N,N-Dimethyldoxorubicin 对一一系列肿瘤细胞系具有细胞毒性 (IC50s < 0.3 μM)。

Cryptolepine 是一种口服有效的多活性生物碱，具有抗癌、抗菌、抗病毒、抗疟疾、抗炎、抗高血糖、缓解疼痛等多种特性。Cryptolepine 可作为 c-Myc、mTOR、NF-κB、HIF-1、MAPK 抑制剂及 AMPKα1/2 激活剂，能嵌入 DNA、抑制拓扑异构酶 II (Top II)，破坏线粒体动力学并诱导细胞凋亡 (apoptosis)。Cryptolepine 同时具有抗疟原虫及胆碱酯酶抑制活性。Cryptolepine 可用于肿瘤 (黑色素瘤、肝细胞癌、乳腺腺癌等)、疟疾、炎症性疾病及糖尿病的相关研究，特别是抑制肿瘤生长与抗疟原虫感染。

Murrayanol 是一种天然的咔唑生物碱，具有多种生物活性。Murrayanol 具有抗炎、拓扑异构酶 I (topoisomerase I) 和 II (topoisomerase II) (Topoisomerase) 抑制活性。Murrayanol 也可作为杀蚊剂和抗菌剂。