L-Leucine-7-amido-4-methylcoumarin (Leu-AMC) hydrochloride 是 LAP3 亮氨酸氨基肽酶的蓝色荧光肽基底物。L-Leucine-7-amido-4-methylcoumarin hydrochloride 可用于亮氨酸氨基肽酶抑制实验。

5-Bromo-1H-indol-3-yl octanoate 是具有 C8 活性的酯酶的显色底物。 5-Bromo-1H-indol-3-yl octanoate 裂解时产生蓝色沉淀。

Z-IETD-AFC 是一种特异的荧光底物，可用于测定 caspase-8 的催化活性。

4-Nitrophenyl-N-acetyl-α-D-galactosaminide (pNP-GalNAc) 可作为 N-乙酰基-D-半乳糖胺酶的显色底物。4-Nitrophenyl-N-acetyl-α-D-galactosaminide 被 N-乙酰基-D-半乳糖胺酶作用后裂解生成黄色溶液，通过吸光度检测定量测定酶活性。

X-GalNAc 是 N-乙酰-β-半乳糖苷酶的显色底物，用于检测琼脂板上生长的细菌中是否存在克隆的 DNA 插入片段。

p-Nitrophenyl phosphorylcholine (4-Nitrophenylphosphorylcholine) 是一种生色型磷脂酶 C 底物。p-Nitrophenyl phosphorylcholine 可被磷脂酶 C 水解，释放黄色生色团对硝基苯酚。p-Nitrophenyl phosphorylcholine 用于测定铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa) 的磷脂酶 C 产量。p-Nitrophenyl phosphorylcholine 可用于铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa) 感染相关研究。

5(6)-Carboxy-2',7'-dichlorofluorescein 是一种荧光素，是MRP2囊泡转运实验的理想底物，具有良好的检测和转运特性。

DABCYL-Glu-Arg-Nle-Phe-Leu-Ser-Phe-Pro-EDANS 可作为人类疟原虫天冬氨酰蛋白酶的荧光底物。

4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate 是一种荧光染料。4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate 可被半乳糖-6-硫酸酯硫酸酶脱硫生成 4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside，后者经 β-半乳糖苷酶切割后释放出具有荧光性的 4-甲基伞形酮。4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate 可通过氢键、静电相互作用和空间位阻相互作用与 N-乙酰半乳糖胺-6-硫酸酯硫酸酶 (GALNS) 结合。4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate 可用作检测半乳糖-6-硫酸酯硫酸酶和 GALNS 活性的底物。4-Methylumbelliferyl-β-D-galactopyranoside 6-sulfate 可用于 A 型 Morquio 病 (黏多糖贮积症 IV 型 A 型) 的研究。